Важнейшими объектами Саккары являются: Ступенчатая пирамида фараона 3 царского дома Джосера (2667 – 2648 гг. до н.э.), построенная его визирем и архитектором Имхотепом; кенотаф Нармера, древнеегипетского царя Первого царского дома; пирамида фараона Униса (5-й царский дом, 2375 – 2345 гг. до н.э.), являющаяся первой пирамидой, на стенах которой были начертаны ритуальные «Тексты пирамид».
В ходе последних работ в Саккара, проводимых археологической миссией, возглавляемой Захи Хавассом, было сделано два важнейших открытия. 2-го июля 2008 года в прессе было рассказано о сделанных открытиях.
В ходе работ, длившихся целый год, археологи смогли полностью очистить от песка неизученную ранее египтологами полуразрушенную пирамиду. Пирамида эта была отмечена ещё Карлом Рихардом Лепсиусом (1810 – 1884). Во время своей экспедиции в 1842 – 1845 гг. он обозначил эту пирамиду под номером 29, она также получила прозвище «Безголовой пирамиды». В дальнейшем пирамида эта, так никогда и не исследовавшаяся, была занесена песками пустыни и забыта наукой. Теперь же её вновь открыли.

Ближайшая хорошо атрибутированная пирамида, - это пирамида фараона Тети, первого правителя эпохи 6-го царского дома.

Сумма всех этих фактов позволила З. Хавассу датировать «Безголовую пирамиду» концом 5-го царского дома.Предварительно была выдвинута пока мало аргументированная версия о том, что создателем «Безголовой пирамиды» мог быть фараон Менкаухор, представитель 5-го царского дома. Цари этого дома возводили свои погребальные памятники в Саккаре и Абусире. Хотя, некоторые исследователя склоняются к более ранней её датировке.
Археологам удалось выявить структуру пирамиды. Построена она была из больших каменных блоков. Всё, что осталось от царского погребения – это лишь крышка от саркофага. По предварительным подсчётам первоначальная высота «Безголовой пирамиды» составляла 45 метров. Ни единого эпиграфического памятника не было найдено, что усложняет датировку и атрибуцию погребального коплекса.
Вторым важным открытием в Саккаре стало открытие священной дороги, датируемой Птолемейским периодом, и описываемой Страбоном. Это – известнейшая аллея сфинксов, тесно связанная с Серапеумом – культовым и священным центром Саккары, где были погребены священные древнеегипетские быки Аписы.
Исследование «Безголовой пирамиды» в Саккаре Первая часть аллеи сфинксов была обнаружена ещё Огюстом Мариеттом-беем (1821 –1881 гг.), выдающимся французским египтологом, основавшим Каирский музей, и основоположником мер по охране египетских древностей. В 1851 году, во время своей второй экспедиции в Египет О. Мариетт открыл эту аллею сфинксов, а чуть позже и сам Серапеум. Теперь же египтологи смогли выявить ещё одну часть этой аллеи, которая была построена при Птолемеях. Рядом с аллеей сфинксов был найден блок из известняка, на котором были надписи, датируемые временем правления Птолемея V Эпифана (205-180 гг. до н.э.)